4果然过了不久，咸阳城内便飘起了浓浓的中药香味，这香味一直飘进秦始皇的宫殿里，这让他的心情无比的好，仿佛两年之后他吃了那长生不老药，便能永葆青春，享受那一批一批的佳人。但是令他头疼的事儿又来了。灭六国后，秦始皇采纳当时还是廷尉的李斯的改革建议，在全国推行郡县制，将天下分为36郡，由郡守再管县。这天，一骑快马飞进都城，来禀报的是齐地的官员，声称形势危急，齐人有造反之嫌。秦始皇勃然大怒，问何人吃了豹子胆。“是博士淳于越。”
李斯在一旁回答。“那快将他逮来，朕要问罪于他。”
秦始皇吼道。李斯当即安排，差禁卫军十人前往齐国。这十人都是武功高手，骑快马日夜奔驰，第三天便到了齐国境内。虽然齐国已亡，但看上去归顺秦朝的氛围不浓，使人潜行到淳于越府第附近后先安顿下来，再打探消息。原来博士淳于越在当地具有崇高威望，连驻军都畏他三分。探子探得消息，这淳于越每晚在府上讲学，最近的课题就是反对郡县制。是夜，淳于越又在府上聚众讲学，禁卫军们悄悄抵近他的府上，见里面灯火通明，不时传出阵阵掌声。淳于越正慷慨激昂地讲述分封制的好处，大门破开，禁卫军一标人马持剑冲进来，“大胆反贼妖言惑众，该当何罪？拿下！”
为首的一声喊，淳于越就像一只小鸡被提在空中，等到听讲的人醒过神来，淳于越已被装进麻袋，一阵马蹄声，一标人马迅速消失在黑夜深处。淳于越押解到秦始皇面前，却不肯下跪，卫兵用剑背朝他腿弯打去，淳于越跪了下去，接着又忍痛站起来，卫兵又打，他再咬牙站起来。两个卫兵便上前摁住他的头，可怜的博士淳于越便跪下了。秦始皇盯着这个白面书生半晌，突然发问：“说！你为何违背朕的旨意？”
“那是因为你违背了天的旨意，自周朝以来一直实行分封制，而你却要搞什么郡县制，周朝时本来县比郡大，现在郡却比县大，这不是颠倒黑白么？”
淳于越毫无惧色。“天下是朕的，朕要怎样就怎样！”
“哼，天下是天下人的天下，不是你嬴政一个人的！”
“朕马上就让你看不到天，推出去斩了！”
淳于越被拖出去时，一路叫着：“暴君，你是什么始皇，你是一堆狗屎！”
士兵一掌便打得他说不出话来。淳于越死了。大殿里只剩下秦始皇和李斯。秦始皇有些得意地说：“他以为他的脖子有刀硬！”
“皇上，他的肉体确实没有刀硬，但有比刀更锋利的。”
李斯小心翼翼的说。“世上还有比刀更锋利的武器？”
“是的，是人的思想。”
“思想？思想有什么了不起，朕取了他的人头，他还怎么思如何想？”
“非也，刀有形，人有形，而思想无形。刀不在，人不存，而思想存焉。”
秦始皇听罢，若有所悟，他说：“你的意思必须统一思想，控制舆论导向。”
李斯点点头说：“五帝做过的事，不能再重复，三王做过的事，也不能再承袭。淳于越主张的事，是夏商周三代的事，又怎能再效法呢？在过去，诸侯相互讨伐，优待到处游说的士人，现在天下平定了，法令统一了，他们仍在非议。在朝廷上他们内心不满，就在心里非议；回到街巷里就要说三道四，造成人心混乱，严重影响皇上的权威。”
“那你说怎么办？”
秦始皇问。“臣下请求，不是秦国的历史，全都烧掉，不是博士官掌管，在全国私人手中收藏的《诗》《书》和诸子百家的书，都让各地的郡守、都尉搜集起来烧掉；敢相互谈论《诗》《书》的，一律处死，拿古代的事非议今天的时政的，一定要处族刑；官吏们有发现这样的人而不举报的，同样处置。”
“可是烧了书，他们的思想还是可以传播呀。”
“再坑杀。”
李斯简短的话语里充满了杀气。“好好好，真没想到丞相比朕还毒呀。”
“这都是为了朕的天下。”
“这事就交给你具体操作吧，你先列个名单，宁可错杀三千，不可漏掉一个。”
秦始皇说罢，挥了挥手。一个月里，按照李斯列的名单，分布在全国的460个学者全部押解到咸阳，咸阳城北两公里处，早挖好了一个大坑，深约一丈，长宽各十丈，反剪双手的学者们蒙着双眼，被一个一个推倒在大坑里，然后由士兵疯狂填土，秦时一代精英，基本上完蛋了。次年春天，附近小山上，每遇阴雨天，便听到这些学者在哭嚎，消息传到秦始皇耳里，他不相信，于是来到那小山前，却没有听到传说中的哭嚎声，一怒之下斩了通报消息的人。但是每到阴雨天，咸阳城里的百姓还是听到了这种哭嚎声，恐惧的情绪在咸阳城里蔓延。李斯再次前往坑杀学者的地方，正是阴雨天，李斯果然听到了哭声，身上不禁起了鸡皮疙瘩。他忽然想起炼长生不老药的侯生和卢生是术士，便前去求教。卢生一听，不知如何回答。侯生微闭双眼说：“必有大冤！”
李斯连忙说：“打住，先别说这个，二位可有妙法？”
“且带我们去看看。”
侯生对李斯说。李斯便带他俩前往坑杀学者的地方，雨仍在下，哭嚎声是从附近的山上传来的。侯生便抚掌一笑：“不难不难。”
于是请李斯满足他两个条件。李斯说：“只要能消除这妖声，百个条件都可以。”
“差兵士将这山上表面的石头运走，扔到渭河里去；再杀一千只公鸡，将它们的血淋在坑杀学者的这块地上。”
李斯便照侯生的要求做了，搬石头容易，士兵多的是，可是一千只公鸡在咸阳城里竟没有凑齐，不得不派兵到乡下去抓鸡，一时弄得鸡飞狗跳的。咸阳乡下的农民，此后几百年不敢多养公鸡。再遇阴雨天时，那哭嚎声果然没有了，李斯将此事禀报秦始皇，秦始皇对侯生和卢生的本领更加深信不疑，立即赏赐他们一些钱和绸缎。侯生和卢生得到赏赐，欣喜不已，买了好酒两人对饮，卢生问：“你这招数有什么道理呢？”
侯生说：“我也是蒙的，我估摸着那小山上的石头含有磁性，坑杀学者的那天一定是雨天，他们的哭声被含有磁性的石头吸收了，所以再遇到相同的气候条件，那些声音就会从石头里释放出来。”
卢生便对侯生更加刮目相看了。