在西维尔的规划中，往后帝国将在各个星区建立专门的指挥部。设司令部、政治部、后勤部等领导机关，管理星区内的各种部队。
负责辖区内诸军、兵种部队合同作战的指挥和所属部队的军事训练、政治工作、行政管理、后勤技术保障，动员工作和战场建设。领导星区内的所有行星防御部队、星界军、帝国海军。
一支融合太空、网络、威慑、运输、电磁频谱、导弹防御等各种能力的联合作战部队。能够从全部作战领域向敌人发起攻击。
因此，在战斗过程中，军队可以通过自己的优势领域向敌军施加更大压力，使敌人的力量难以得到最大程度的发挥，进而扩大不对称优势，最大程度展现自身实力而削弱敌军力量。
这种统一指挥确实很强，但某些帝国子民就要问了。这种拥有星际航行能力，拥有足够部队占领行星的部队，万一叛乱怎么办？当初基利曼不就是为了防止叛乱才把凡人辅助军给拆成星界军和帝国海军吗。
西维尔只能说有许多种方法防止叛乱，而以这种拆分军队，大幅度削弱己方战斗力的方法来防止叛乱，只能说是下下策。
而且现在的情况和当初基利曼遇到的情况不一样了。当初基利曼拆分军队，防止叛乱，切断了两支军队的联系。但如果有需要，在他的领导下，在无数蓝子蓝孙的指挥下，帝国军队随时可以暂时变成大远征时期的战斗模式。
这样看来战斗力其实也丧失没多少，叛乱风险还大大降低。但意外总是频频发生，恐怕基利曼也没想到，帝国失去了帝皇和原体的领导后，会堕落成这个样子。
基利曼的想法确实没错，哪怕在帝国失去最后一位原体领导后，大规模的叛乱也几乎从未发生。
但睿智的高领主加上被拆分的两支军队，使得帝国上下全是各种小叛乱。量变产生质变，叛乱依旧牵扯着整个人类帝国最多的精力。
如果基利曼醒来，看到现在的帝国，一定会破口大骂：他妈的，国家怎么成了这个样子。
然后气的宣布人类将在他的领导下重组和重新武装帝国。
对于防止叛乱，其实西维尔本身——一名现存于世的帝皇子嗣。就是最好的防止叛乱的手段。西维尔还会给那些军官配上参谋长，政委。将叛乱的可能性降到最低。
而且如今的帝国比之基利曼当初，有了深入人心的帝国信仰。如今西维尔更是大力推崇救世新教，希望将信仰传播到银河中的每一名人类。大家把帝皇和西维尔当做神灵来进行崇拜，这些信徒们怎么会反叛帝国。
以后西维尔将实行军教结合，每一名士兵都必须信仰救世新教。
除了在信仰上来防止叛乱。不要忘了，眼下审判庭，刺客庭两者都直接向西维尔负责。
西维尔将会派遣审判庭成员监视，巡查各个星区统帅，而刺客庭则负责暗中监视那些重要军官。一明一暗，双重保险。
同时法务部成员也将监督行星总督是否和某些军队统帅有所勾结，时刻审视他们的忠诚。
除了让国教、审判庭、刺客庭、法务部防止叛乱外，西维尔对他们有许多其他的改革。
国教以后将会去军事化。无论是救世新教的护教军，还是曾经国教的十字军、圣殿兄弟会、教会民兵等部队，都将归为军机处管理。
但同时，西维尔将会推动国教渗入到帝国的方方面面，无论是官员还是士兵，都需要是虔诚的信徒才能担任。政府将会组织专门的祷告会，部队中将有专门的随军牧师。
每一个人类行星都要建立起教堂，庄严的传教士和虔诚的信徒们将在那里祈祷和工作，度过一个个日夜，在银河中传播帝国信仰。
对于审判庭，西维尔则新建了一个讨逆修会，或者说异端审判庭。主要负责传达君令，监督将领，防止兵变，规范军纪，确保人们拥有正确的信仰，监督国教传播的教义的纯洁性。
在审判庭中，其实有着众多分支。且这些审判庭分支无论大小，都是同一地位。审判庭中既没有正式的等级制度，也没有集中的领导权。
这也是曾经高领主议会中是“审判庭代表”的席位，而不是“审判庭庭长”。
这些审判庭分支的成员被称作审判官。而这些审判庭的分支机构与审判官之间没有明确的效忠或契约关系，一个审判官可能同时加入到多个审判庭分支机构当中，有些审判官甚至拒绝加入任何分支。
西维尔创建完异端审判庭后，召集了许多审判官，对他们进行了一番教育，除了让他们要服从自己的命令外，还为了修正一些审判官的行事准则。
比如恶魔审判庭的审判官以及他们的盟友灰骑士。这些审判官在清理完恶魔后，往往还会清楚所有目击者。尤其是灰骑士，为了保证混沌的信息不被泄露，就连看到他们作战的战友事后也会被灭口。
星界军、帝国海军、机械教都不例外。一场战斗结束，你会发现恶魔杀得人还没审判官和灰骑士杀得人多。
虽然这种事也不是经常发生，灰骑士也不是次次都灭口。但西维尔希望这种事以后一次都不要再有。
这种方法或许最简单省事，最有效。但西维尔还是希望能用更温和的办法来防止混沌的传播。以后帝国将会有更好的办法来解决这些问题，无需每次都搞得血流成河。
刺客庭没什么好说的，西维尔让他们成为自己监视整个帝国的一只眼睛，让他们助自己更好的掌控帝国上下。
法务部则被西维尔给予了更多职责。行星总督的暴力统治、无能腐败如今归法务部也必须管理。各个行星上的法务部成员发现这样的行星总督应立即上报，然后配合帝国新派来的行星总督接管整个行星。
对这些帝国的重要部门进行改革，是西维尔在接下来的几年中的首要工作。