经过长达半年的搜寻，金莉丝只在地表上，找到三个新文明的人——如果程深和他的两名手下也算的话。
在底层逻辑的控制下，金莉丝果然按照程深所期望的那样，开始了人类复生程序。
沉寂已久的“生物计划”总部被重新启动，环形机器开始轰鸣着运转起来，金莉丝由战争和扩张状态，开始转化为研究状态。
原先生产战争机器的工厂，已经全部停工，所有的资源都被用来进行人类复生的任务。
程深和曾宜、陈博史，开始了漫长的休闲生活。
他们无事可干，只需要等待结果。
有两个人陪着聊天，程深的漫长等待也不至于太过无聊。
再加上有新文明的电影和小说，还能用来打发时间。程深的全人类资料库中的那些小说，几十亿年中被程深看的差不多了，即使是几千万字的小说，程深也一路啃了下来。
十五年后，曾宜因为疾病去世。
二十年后，陈博史去世。
如今的地球，再次只剩下了程深一人。
不过与以往不同的是，现在的地球显得要热闹很多。
灰色的树叶在山林的晚风中此起彼伏，机器人在大陆还海洋上忙忙碌碌，自然与机器交织在一起。
程深找到了它的鲲鹏。
时隔多年，程深的鲲鹏依然还生活在深海中。
几十年前，依靠着从它们身体上获取的组织样本，新文明组建起了强大的鲲鹏大军。
如今时过境迁，鲲鹏大军已然消散，金莉丝也进入了人类复生程序，程深的鲲鹏仍然在极地的深海中生活着。
由于生活在极地的深海中，因此程深的鲲鹏躲过了金莉丝的围攻，没有像鲲鹏大军一样被毁灭。
坐在了鹏的背上，体型巨大的鹏载着程深，在天空中翱翔，扶摇直上。在下方的茫忙海洋上，鲲喷吐着海水，庞大的身影在海面下浮浮沉沉。
“一千多年了，还是像当年一样啊，我的老朋友们。”程深不由得感慨一句。
话虽如此，但是程深已经能感受得到，自己的这两个老朋友，身体已经大不如前了。
活了一千多年，对于鲲和鹏来说，也差不多走到了生命的终点。
特别是在如今的地球环境中，与当年古原龙生活的时期有了很大的变化。
鲲和鹏是本应该生活在古原龙时代的生物，现在的环境对它们来说并不适合，能活这么久已经到了它们的极限。
在这最后的时间里，程深想要陪陪这两个老朋友，就像当年刚刚遇到它们时那样。
想当初，程深第一次遇到鲲，是在一处沙滩上，程深遇到了搁浅的鲲，然后将它救了起来。
至于鹏，则是程深追了大半天，终于在海洋深处骑着鲲把鹏累趴下了，栽倒在了海水中，被程深捡了起来。
时间一晃而过，眨眼的功夫，一千多年就过去了，那些时光仿佛还发生在昨天。
一路走来，程深先是熬过了漫长的孤独，目睹了地球的毁灭和新生，等到了新生命的出现。
然后又经过了几十亿年的等待，才等到了新文明早期的出现。
再之后，程深的生活就没有那么孤独了，他是一位幕后操控者，操控着一千多年来的新文明发展。
在这过程中，程深也遇到了一些朋友，地球上变得热闹了起来。
然而，这一切在缓缓走向结束，再精彩的舞台剧，也有落幕的那一天。
地球上的新文明毁灭了，只剩下少数的人逃到了深空。程深的两个老朋友也走向了生命的终点。
一年后，深海。
程深站在鲲的背上，轻轻的抚摸着鲲的额头，就像当年他刚捡到鲲一样。
海面上的鲲显得很疲惫，它已经走到了寿命的终点，在海面上无力的漂浮着。
“老朋友，睡吧，我们会再见面的。”程深抚摸着鲲的额头，小声的说道，“下一次再见的时候，我会再把你从沙滩上救下去的。”
鲲发出了一阵低沉的声音，在回应着程深。陪伴了一千多年，它也不想离开自己的老朋友。
可是，在时间面前，谁又能抵挡时间的侵蚀呢？
除非……程深遥望东方大陆，“生物计划”总部所在的方向，要不了多久，曾经的人类就将复生，他也将获得穿梭于时间的力量。
到那时，时间将和长、宽、高一样，成为程深能够行走的存在。
金莉丝的速度很快，它在经过了两千亿次的模拟实验失败后，终于根据人类细胞蓝图，成功制造出了人类细胞。
现在，只需要将人类细胞培养、分化、分裂，就能培养成人类的胎儿。当人类胎儿睁开眼睛，时隔几十亿年再次打量着这个熟悉又陌生的世界时，程深就完成了他的任务。
一个小时后，程深感觉到脚下的鲲缓缓沉了下去，程深知道，他的这位老朋友要离开他了。
一鲸落，万物生。
鲸鱼死亡后沉入海底，它的身体可以供给海底生物一个长达百年的生态系统。
鲲也是如此，它选择了死亡后沉入海底，它来自自然，又归于自然，这是它所选择的结局，对它来说未必不是一个好的归宿。
一个月后，鹏也离开了程深，程深站在山林中，再次为他的又一位老朋友送行。
当这一切的表演刚开始时，程深孤身一人。
当这一切的表演结束后，程深依然孤身一人。
他与孤独为伴了几十亿年，早已经习惯。对于程深来说，热闹是偶尔而短暂的，孤独是长久而永恒的。
十年后。
程深来到了“生物计划”总部，金莉丝依然在其中忙碌着，程深走进去时，没有受到阻拦。
事实上，只要程深不做任何损害“生物计划”的举动，金莉丝都不会有功夫搭理他的。
来到环形大厅中，最中间的一个一人多高的圆柱形仪器中，一个人类的胎儿正在安静的成长着。
程深站在这个圆柱形仪器前，透过玻璃窗，静静的看着眼前的胎儿。
激动、狂喜……程深曾经无数次梦到过这样的场景，想象着自己会有多么的激动和兴奋。
然而，经过几十亿年时间的沉淀，当真正见到这一幕时，程深心中只剩下宁静。
仪器中的胎儿微微动了动，原本紧闭着的双眼缓缓睁开，他努力的想要睁开自己的双眼。仪器察觉到了胎儿的变化，其中的水缓缓抽干，模拟着胎儿出生时的环境。
只听得一声清脆的啼哭，他缓缓地睁开了自己双眼，好奇的打量着眼前的世界。
在这一刻，他的目光和程深对视在了一起。