从外观和改造的难易度上来说艨艟是首选，但赵昺却没有选择它。这是因为战船是用来作战的平台，还需要搭载武器。
在这个时期战船交战的方式除继续沿用古老的接舷战的同时，更为注重抛射武器的运用。一般情况下，双方是隔着一定距离作战，因而抛射武器在海战中发挥的作用越来越大。便有了海战中‘弓矢为上，钩枪次之，手刀又次之’的说法。而由于火器的发展，火箭和火砲此类武器在海战中也格外引起重视。
当然宋元时期的火箭和火砲的应用还处于最初级的阶段。火箭不过是在箭矢上捆绑一个药筒，点燃后再用弓弩发射，以增加射程。而火砲也不是现代意义的金属身管火炮，只是以抛石机为动力发射的火药包。但因为此类武器既是抛射武器，又带有火攻的性质，在杀伤敌军的同时，又能摧毁敌船，还是受到了各方的重视。
为了能够在海战中取得优势，赵昺已经‘发明’了弩炮，并用于实战，取得了不俗的战果。这便解决了由于没有火炮，而又需要远程大威力武器的问题。但弩炮比弓箭不知重了几十倍，所需要占用的空间也大的多，操作弩炮的射手同样要需要多人完成，显然艨艟小巧的船身和较低载重量难以胜任。
另外龟船除了远程武器外，还具有一项必杀技，那便是依靠船头上的冲角撞击敌船水线下的船体，使敌船进水沉没。为了获得最大的冲击力，除了船只要有较快的速度外，还要有较大的体量，否则撞上后，沉的不知道是谁呢？而同归于尽也不是赵昺想要的结果。艨艟这几项致命的缺陷使其不得不出局。
以战船为载体进行水战的另一个特点是：战船必须根据战场的具体情况随时调整火力和兵力的配置，这就需要其具有良好的机动性能，快速分合聚散以取得战场的主动权。相反，战船失去机动性，则处于攻亦难攻，守也难守的境地，成为敌军肆意攻击的固定目标，从而失去战场的主动权。
艨艟采用桨橹为动力，机动灵活。但海船体量大，所以主要是靠风帆为动力，因此受气候，主要是风力影响明显。在顺风的情况下，水军战船乘驶自如，可以乘风直捣敌阵，尽量利用风力的影响，化为自己的优势。同理，要是逆风的情况下便会陷入机动困难，被动挨打的境地。而龟船是以突袭为主要战术选择，具有良好的机动性是必须的。显而易见海船难以胜任。
这样一来多桨船便成了最后的选择，其机动性虽不如艨艟，但其船身长八丈三尺，阔两丈，载重达八百料，可载兵士二百人，完全可以满足搭载弩炮和兵员的要求。且其体量较大，配上冲角在撞击中既能重创敌船，又能保证自己的安全；而多桨船顾名思义是以桨划水驱动船只航行，其用桨四十二只，可以保证它能有较高的航速，有良好的机动性，改造时加装桅帆，同样也具有靠风航行的能力……
“这也许便能守住琼州吧！”赵昺敲定了改造方案，也算是放下件困扰他多时的心事，大松了口气喃喃道，而脑海中出现了一副海上大战的情形。
海峡中宽广的海面上两军对垒，我军首先派出火箭船前出在远距离上实施打击，在漫天飞舞的火箭轰击下，敌船或被击中起火，或极力躲避，混乱中相互碰撞，造成了极大的损失；待火箭攻击完毕后，敌重整队形欲再行发起攻击时。伏于暗处的龟船发起突袭，在中远距离上弩炮不断发射，杀伤敌船上的水兵，击毁他们的桅帆。
敌船虽以抛石机和弓弩对龟船进行打击，但其背部的铁甲为它提供了良好的保护，无法对我方造成致命的伤害。在双方接近后，龟船转而使用冲角撞击敌船。而敌方士兵则想进行贴身近战，当他们成功跳到龟船背上时，才发现上面林立的铁刺成为新的噩梦，不是被刺伤刺死，便是不敢再动。有幸攀上船舷的，却被龟船中的战兵发射的箭矢或刺出的长矛击中，终难逃一死。
经过两轮打击的敌船队此刻已经元气大伤，这时以大型战船组成的我水军船队发起最后的攻击，以泰山压顶之势碾压敌小型船，夹击敌主力战船，同时以装备的弩炮继续杀伤敌船上的敌兵，掩护我军战兵进行接舷战，杀伤敌船员，俘获敌船，结束战斗。
当然这种理想的状况只能在敌我兵力相当，或是敌军略占优势的情况下。而如果在敌军拥有绝对优势的兵力或是多路进攻的形势下，恐怕依靠自己水军的兵力难免捉襟见肘，难以实现所想，毕竟蚁多也可咬死象，那抗登陆作战就将难以避免。
“敌军强行登陆，我又该怎么守？”刚刚欢喜了片刻的赵昺想到这个问题又愁上心头，除了龟船、弩炮和火箭自己还有什么可以利用，他又陷入了苦思之中。他觉得自己就像处于风暴眼中，虽然暂时躲过了狂风怒浪，但周围却是滔滔恶浪，稍不小心便又将投入其中，自己必须小心的躲过，要不就只能迎上去。
“殿下，潘副使今晚便要率船队起航，押送最后一批物资前往琼州，他特来辞行，同时问问殿下还有何事情交待。”就在这时，一个小黄门在王德耳边低语了几句，他又凑过来禀告道。
“本王没有什么事情，就按照预定的计划行事便可，我还有事情要想，便不见他了。”赵昺听了看看天已过正午，皱下眉道，显然对被人打断了思路有些不满。
“好，小的这就转告潘副使！”王德笑笑说道，退后出门。
“等等，命令潘副使取消所有出航计划，并令泊于外港的船舶全部进入内港，派水军巡视外海命留于外海船只在日落前必须全部回港！”王德的脚刚迈过门槛，便听到殿下急吼吼地喊声……