这段时间，郑军也没有闲着。 与晋军一样，郑军的行动效率也非常高。 郑森将东番岛的南部赤嵌城所在地区划为承天府。 开始建造新城，安置人口。 郑森放权给陈永华、刘国轩这些年轻的文官，以他们为咨议参军。 于是陈永华等人开始为初辟的台湾展开城乡聚落的空间规划。 他们首先区分承天府为东安、西定、宁南、镇北四坊，同时又制定郊野为三十四里，每里都设有社，社立小学。 除了承天府城中以圣庙学校为神圣中心之外，依陈永华等人所置村里还有社。 社者即社祭与社学，以教村里聚落中庶民之子的小学也。 这与李嗣兴的三党制，以及在各党设立学校有异曲同工之妙。 这样，在第二圈的空间中，也建构了散布各地的村级聚落的神圣中心，同样是以儒家教化为其性质。 而这两圈的教化空间的基础，就是生产谷类和甘蔗的东番岛肥沃大地，也就是第三圈空间。 因此以三层空间圈铸就了郑军的统治基础。 那些从江南强制迁徙来百姓，也被分成了一个个家庭。 原本是一家人的依然生活在一起，原本的单身汉，则由官府安排婚配。 婚配的对象也是从江南掳掠来的女子。 如此来看，郑军这次在江南的行动，更像是一次武装大移民。 郑森一开始就考虑了迁移人口的成分搭配，不仅仅男女都有。 就连读书人的比例都考虑到了。 因此，陈永华等人的改革才能够进行的那么顺利。 这些移民中还有一些富户。 郑森将他们安置在城市中，发还了一些财产给他们，让他们继续从事商业活动。 东番岛西部的土地完全可以媲美江南。 此时在小冰河期，这里的气候宜人，降雨丰沛，实在是进行农业生产的好地方。 陈永华等人为郑军在东番岛的空间规画，其理念乃源自儒家传统，合于《系辞传》所标举的生生大化的天地空间之大义。 一开始陈永华等人向郑森提出“建圣庙，立学校”的建议。 但郑森认为：“荒服新创，不但地方局促，而且人民稀少，姑暂待之将来。”
陈永华引经据典，力陈教育之重要。他认为，东番岛沃野千里，远滨海外，民风纯朴，若能举贤才以助理，经过一段时间教养生息，便能赶上中原地区。 应当择地建立圣庙，设学校“以收人才，庶国有贤士，邦本自固，而世运日昌矣”。 最后郑经被说服，同意设立学校，发展东番岛文教事业，并授命陈永华负责有关事宜。 陈永华创建一套自上而下较为完整的教育体系。在全岛设立“国子监”，为最高学府，各府、州、县设立“府学”、“州学”、“县学”。 还要求岛上的高山族同胞居住区的各社设立“小学”，方便高山族子弟入学受教育。 为了减轻高山族同胞的负担，鼓励他们送子入学，特地规定，凡是高山族子弟“就乡塾读书者，蠲其徭役”。 他把教育与选拔人才相结合，推行大陆的科举制度。规定东番岛上的儿童必须“八岁入小学，课以经史文章”。 三年两试，“照科、岁例开试儒童。州试有名送府，府试有名送院，院试取中，准充入太学，仍按月月课。 三年取中试者，补六官内都事，擢用升转”。 于是，东番人民“自是始奋学”。 陈永华在承天府宁南坊择地建造了圣庙学院。 郑森进驻东番岛之后，也并没有立即放弃其控制的温州、富宁二府。 思明府是其老巢，经营日久更是不可能放弃的。 得知郑森入驻东番岛的消息后，满清水师提督施琅帅兵攻击过几次思明府，不过全都被郑军击退。 因为郑森加强了对东番岛陆地上的防护，依然将水师的主力放在金夏地区。 在他看来，满清依然是他最大的敌人。 到此为止，郑森依然没有放弃对付满清。他还没有放弃自己的初心。 但是在中土的那些士大夫看来，郑军已经退出了中土争霸的舞台。 人一旦安定下来就没有动力去冒险了。 温州府的郑军面对清军的浙江兵马的猛攻，最终在坚守了半年时间后撤退。 不过在此之前，郑军几户将整个温州府给搬空了。 整个府几乎被整体搬迁到东番岛北部的淡水城附近。 富宁州西边的建宁府已经被晋军控制，北边又有雁荡山与浙江隔开，郑军只要守住北边的分水关就好。 南边的福州和泉州还在清廷的手中，但是受到了晋军的威胁，本来就只是苦苦支撑。 因此郑军依然守着福宁州，封锁满清对福州和泉州的支援。 …… 正当郑军在东番岛种田，李嗣兴正在武昌城中主持改革，调拨资源，准备策划一次大规模行动的时候。 京城中却发生了一件惊天动地的大事儿。 满洲人的天塌下来了。 顺治十八年正月初二，顺治皇帝安排吴良辅出家为僧。 这天他亲临悯忠寺观看吴良辅出家仪式。归来的当晚即染上天花，发起高烧来。 董鄂氏染病去世，他没有见上一面，避免了被传染，但是躲得过初一，躲不开十五。 过度的悲伤让他本来就虚弱的身体更加容易染病。 顺治预感病体沉重，势将不支，初六日深夜急召礼部侍郎兼翰林院掌院学士王熙及原内阁学士麻勒吉入养心殿，口授遗诏。 王熙、麻勒吉二人退至乾清门下西围屏内，以初七一天的时间撰拟。 一共三次进给皇上预览，皇帝三次亲自斟酌，刚到晚上才决定。 当夜，年仅二十四岁的顺治帝与世长辞了。这一年，李嗣兴十五岁。 福临晏驾后，麻勒吉及侍卫贾卜嘉二人手捧遗诏去奏知皇太后，马上向诸王贝勒贝子公大臣侍卫等人宣布。 遗诏立八岁的皇三子爱新觉罗·玄烨为皇太子，继帝位，命索尼、苏克萨哈、遏必隆、鳌拜为辅政大臣。 遗诏实为罪己诏，共罗列十四条罪过，主要是未能遵守祖制渐染汉俗，重用汉官致使满臣无心任事，几乎完全否定了他自己一生中最有光彩的政绩。 至于这是否福临本意，即这十四条是否福临过目批准的已无从知晓。 但却留给了后世之疑：遗诏公布前先奏知皇太后；遗诏的主要起草者王熙事后对此守口如瓶。因此，人们有理由说遗诏本出太后授意，确实是母亲责备儿子的话。