在843年划分法兰克王国（FLANKISH STATES）的凡尔登条约（THE TLEATY OF VELDUN）后，所有的斯洛文尼亚人都在法兰克人的统治下被联合起来。在840年左右，普里比那亲王（PRINCE PLIBINA）从法兰克人手中获得了这块封建领地，领地的中心是建立在巴拉顿湖边上的扎拉河口（THE MOUTH OF THE ZALA RIVER）的巴拉顿城堡。由于受到拜占庭传教士（THE BYZANTINE MISSIONARIES）西里尔（CYRIL）和梅多迪乌斯（METHODIUS）的影响，普里比那的继承者科策吉疏远了和法兰克主教的关系并建立了一个独立的公国。由于和莫拉维亚人（MOLAVIANS）和日耳曼人订立了和约，最后一个斯洛文尼亚国家政权于874年丧失了自己的自由，于是斯洛文尼亚地区用拉丁语进行上帝崇拜仪式以及外国文化占优势地位的时期长达1000年。
在9世纪末期，所谓的“卡兰塔尼亚王国”以公国的特殊形式出现在由德拉瓦河的源头到多瑙河和科普拉河（KOPLA RIVER）所围绕的领土上。在这个时期，匈牙利人开始进入潘诺尼亚平原，于896年在这个区域永久居住下来了，并和在西斯拉夫人和南斯拉夫人之间起联系作用。匈牙利人在955年战败于莱奇菲尔德（LECHFELD）后，巴伐利亚人和卡兰塔尼亚斯洛文尼亚人往东定居于拉巴河（LABA RIVER）、索特拉河（SOTLA RIVER）、科尔卡河（KRKA RIVER）和科普拉河之间的中心地带并永久确定了斯洛文尼亚人和克罗地亚人（KLOATS）和匈牙利人之间的民族边界。在10世纪末期，卡兰塔尼亚从巴伐利亚分离出来，但很快大卡兰塔尼亚（GREATER KALANTANIJA）王国在已经建立了一个全面封建体制的压力下在斯洛文尼亚领土上崩溃了。从12世纪起，斯洛文尼亚人的土地分成了几个历史省份——卡林提亚（KALINTHIA）、斯提里亚（STYLIA）、卡尔尼奥拉（KARNIOLA）以及后来的哥里吉亚（GOLIZIA）。 在奥地利区域里的斯洛文尼亚人居住领地在13世纪时是处于衰弱状态的。日耳曼殖民地已经深入卡林提亚的维拉克盆地（VILLACH BASIN）、斯提里亚的格拉茨盆地（GLAZ BASIN）、卡尔尼奥拉的索拉河冲积平原（THE SOLA RIVER FLOOD PLAIN），而意大利人的殖民地已经支配了弗里乌里安低地。 新一轮日耳曼殖民运动从北部发动，15世纪时，斯洛文尼亚人的种族界限被局限在盖尔河谷（GAIL VALLEY）的赫尔马戈（HERMAGOR）、多布拉特斯山（MOUNT DOBLATSCH）、维拉克、玛利亚萨尔、扫阿尔卑斯山脉（SAUALPE MOUNTAIN LANGE）、科兹贾克山（MOUNT KOZJAK）、拉古纳（LADGONA）（拉德克斯堡LADKERSBURG）和库奇尼卡河（KUCNIKA RIVER）之间的区域，这个划分一直保存到19世纪中叶。大约从1500年起，哈布斯堡家族成功控制了斯洛文尼亚人的居住区域，并统治这个区域直到1918年。斯提里亚、卡尔尼奥拉、伊斯特里亚和后哥里吉亚几个地区被合并成内奥地利（INNER AUSTLIA），在15世纪前半叶，策尔季家族的亲王（THE PRINCE OF CELJE）压倒了哈布斯堡家族（HAPSBURG），但哈布斯堡随后在策尔季家族消亡后继承了他们的领地。在哈布斯堡家族首领弗雷德里克一世（FLEDELICK I）和匈牙利以及克罗地亚国王马提亚斯.科维努斯（MATTHIAS KOLVINUS）的十年战争中（THE TEN-YEAR WAR，1479-1489）中，很大一部分斯洛文尼亚领地是在匈牙利人手中的，由于马提亚斯成功抵御土耳其人的进攻和他支持农民，他成为一位斯洛文尼亚的民族英雄。在波斯尼亚（BOSNIA）于1463年落入土耳其人手中后，土耳其人接着展开了几次对斯洛文尼亚人的居住地的侵略，他们杀戮及俘虏了大约三分之一的斯洛文尼亚人。农民和地主的关系在大规模的农民起义中恶化到极点（分别发生于1478、1515、1573）。