还让蓟州镇、辽东都指挥使司各地原来的将领们监管各处，见机行事时不必受到其他人的限制。并且提升明山海卫监军副使：阎鸣泰，为〈辽东总镇巡抚〉又重用明兵部职方武选清吏司主事：鹿善继、明兵部主事：王则古，为「赞画」还请求从国库带走八十万两银子。除此之外还让明山海卫总兵：江应诏，制定军事编制、明广宁前屯卫兵备道佥事：袁崇焕，负责建造营房、明抚夷总兵：李秉诚，训练火器装备、明兵部职方清吏司主事：鹿善继、明兵部主事：王则古，一起处理军需物资。明兵部武选清吏司主事：沈棨、明工部员外郎：杜应芳，维修甲仗、明兵部司务厅司务：孙元化，修筑炮台，明中书科中书舍人：宋献、明羽林卫经历使：程仑，购买军马、明广宁义州卫兵备道佥事：万有孚，采伐树木。至于明广宁中卫游击将军：祖大寿，就继续留在东部的觉华岛内辅助明广宁左屯卫右参将：金冠，海上驻防，明援辽左参将：陈谏，明援辽副总兵：赵率教，驻守广宁前屯卫、明宁远卫游击将军：鲁之甲，负责拯救难民、明宁远卫副总兵：李承先，训练骑兵、明义州卫左参将：杨应乾，招募辽人编制成军队。此外明辽东总镇经略：孙承宗，还发现先前关上的士兵没有纪律，而且有大量的不符合条件人，居然也站出来冒领军饷。于是明辽东总镇经略阅兵后，就将河南府、真定府，等地不符合条件的士兵全部遣返回乡。又将明宁远卫游击将军所拯救出的难民，给征召了七千人出来去驻守广宁前屯卫，再让明义州卫左参将招募的辽人军队去镇守宁远卫，并请求李氏朝鲜王国前来声援辽东都指挥使司，又犒赏东江镇的明定辽右卫副总兵：毛文龙，为〈平辽副总兵〉挂「征虏前将军」印，驻守东江镇，让他四面防卫。并传令给明山东总镇总兵兼山东都指挥佥事：沈有容，进据广鹿岛配合防守以及救援难民。而后明山海卫总兵：江应诏，被弹劾贪污军饷，明辽东总镇经略就上奏朝廷让明三屯营总兵：马世龙，代替，并让明抚宁卫总兵：尤世禄、明广宁前屯卫总兵：王世钦，为南北帅（左右参将）以听从马总兵调遣。明熹宗：朱由校，听从孙总镇经略的建议，还赐给马总兵［尚方宝剑］负责节制关内外门户。两位帝师～明登莱巡抚：袁可立，与明辽东总镇经略：孙承宗，均同为天启二年殿试同考官，他们共同主持辽东都指挥使司战事期间东虏建奴鞑子不敢继续侵略，明辽东总镇经略将海防军务委托给袁巡抚。自己则负责坐守辽东都指挥使司收复失地，但朝廷却有人重视山海卫，而轻视沿海地区，甚至为了节省经费（毕竟江南东林党官员富商巨贾们都被明司礼监掌印太监：魏忠贤，拷打交税）所以竟有人请求朝廷要裁撤登莱巡抚职务！好在明辽东总镇经略深明大义，知道朝廷党争内幕，便苦口婆心上奏劝说道“恢复全辽，必资于海。臣请求陛下敕，部分两镇汛地，酌给山东都指挥使司登莱两卫沈总镇总兵部兵丁，敕登莱巡抚袁大人用心料理，仍令节制两镇，凡一应兵马钱粮、徵收调遣、防剿功罪尽归经理。”
此举被明熹宗批准了。不仅如此，明辽东总镇经略还前后修筑城堡数十座，练兵十一万、造铠甲仗、开屯田，军容颇振。后与众将商议决定守宁远卫，在命明觉华岛游击将军：祖大寿，兴工筑城，共图大举请饷24万，明熹宗命所司给之，可兵、工，二部尚书却忌其成功，故用公文移往别处，以缓慢速度回复，导致筑城士兵竟不能出。8月23日，明熹宗赐封明皇五弟：朱由检，为〈信亲王〉并遣明英国公：张惟贤，持［节钺］再由明中极殿大学士：叶向高、明东阁大学士：韩爌，捧册携百官于皇极门外东庑行礼。年仅12岁的明皇五弟信亲王：朱由检，加冕亲王九章冕服珠帘，正式成为藩王。9月26日，因明熹宗已经大婚完毕，且迎娶了河南承宣布政使司开封府祥符县人士：张嫣，为皇后，故此明都察院山西道监察御史：毕佐周、明吏科都给事中：薛凤翔、明都察院河南道监察御史：刘兰、明东阁大学士：刘一燝，纷纷就上奏请移明奉圣夫人：客印月，出宫。毕竟眼下宫中明奉圣夫人与明司礼监掌印太监：魏忠贤，两人狼狈为奸，专门整惑不服从管理的文武大臣，且魏公公也负责搜刮官员钱财的，因此东林党们非常看不惯他们。但明熹宗依旧恋恋不舍，不忍心让明奉圣夫人离去，便说道“皇后年幼，赖媪保护，俟皇祖大葬议之。”
又加上明奉圣夫人与明司礼监掌印太监勾结，因此后宫中无人敢违背他们的意志，以及明熹宗诏谕内阁群臣们“客氏朝夕侍朕，今日出宫，痛心不止，着以后不时进宫奉慰，外廷不得烦扰。”
有了这道圣谕，明奉圣夫人想进宫就进宫，想出宫就出宫，可谓是来去自如。9月29日，明山东总镇巡抚：赵彦，攻破了兖州府滕县，白莲教教主：徐鸿儒，被俘造反失败，明山东总镇巡抚安插归降乡民二万七千余人，剿获骡马千匹、神枪八百杆、大炮二百零六门，弓刀甚多。10月初9日，李氏朝鲜平山府使：李贵，与李氏朝鲜长湍府使：李曙，并为政变核心中，仅有的两名担任官职者，他们两人约定在当年冬天举事。然而此后他们的计划却一波三折，先是李氏朝鲜平山府使欲以李氏朝鲜安州牧使：申景禛，为自己属下的中军，但李氏朝鲜安州牧使行踪诡异，又遭到了李氏朝鲜领议政：朴承宗，的怀疑？就请求李氏朝鲜郡王光海大君：李珲，调任申景禛为〈晓星岭别将〉。11月初8日，反贼白莲教教主：徐鸿儒，被押解至北直隶顺天府帝都紫禁城内斩首示众，在山东承宣布政使司传教二十年，造反七个月便失败。12月初3日，明贵州总镇巡抚：王三善，大会将士，准备分兵三路进军，还下令许进不许退，遂夺回龙里军民卫，又乘势追击。其中水西叛军48支头目：安邦俊，被明军炮火炸死，水西叛军首领：安邦彦，则趁机逃走，明军遂抵达都司府贵阳府城下，如今的贵阳府被围十余月，城中住户十余万，现在仅剩下二百余人。12月初8日，明军成功收复贵阳府，水西叛军首领：安邦彦，被吓得远遁新贵县西北处的陆广河巡检司外。当时湖广都指挥使司、广西都指挥使司、四川都指挥使司，三处援军皆先赶到，一下子聚集了大批军队，后勤问题自然需要解决，因此明贵州总镇巡抚：王三善，便采取了因粮于敌政策，以明威清卫游击将军：刘超，为［贵州府副总兵］与明铜仁府总兵：张彦芳、明平坝卫都司：线补兖，三路并进。同时大明帝国附属国李氏朝鲜这边，李氏朝鲜平山府使：李贵，因遭到了司宪府的弹劾，被罢免了官。于是李贵的举事计划，又被迫中断。不过此时有一个叫柳天机的人，趁机向朝中权贵告发李贵居心叵测，因此大北派李氏朝鲜广昌府院君：李尔瞻，遂指使两司（司宪府、司谏院）上疏揭发李贵有：扶护西宫（李氏朝鲜仁穆大妃）之谋，并请求李氏朝鲜郡王光海大君：李珲，对；李贵、金自点，这对亲家予以逮捕彻查。由于李贵之女和金自点贿赂了李氏朝鲜郡王的宠妃李氏朝鲜尚宫：金介屎，请其疏通关系，而李氏朝鲜郡王也早已不满北大派弄权，所以才决定放西人党李贵他们一码，至此整个政变集团逃过一劫。为了避嫌，举事计划又推迟了两个月。明天启三年公元1623年正月初6日，明贵州府副总兵：刘超，等将领陆续赶至陆广河巡检司，明军连战皆捷，开始有些轻敌之心。而水西叛军首领：安邦彦，则趁机联合叛贼大梁王：奢崇明、叛贼乌撒军民府知府：安效良，两处军队开始布阵，一路叛军负责引诱明军渡陆广河巡检司，一路引诱明军在毕节卫七星关守御后千户所鸭池河，这两地大败明军。除了明贵州府副总兵逃出来之外，明铜仁府左参将：杨明楷，被俘，明铜鼓卫指挥佥事：姚旺，等二十六位将领均战死。其中龙里军民卫一带，又复为叛将：何仲蔚，所占据！此举导致水西叛军们士气高涨，欲再次兵围贵州宣慰使司境内的贵州都指挥使司都司府（贵阳府）以至于远近卫所州县纷纷震惊，也让水西叛军首领：安邦彦，露出了兴奋的獠牙，也开始有模有样称王，号称「罗甸大王」设文武百官，成为割据政权。然而另一路在四川承宣布政使司反叛的大梁王：奢崇明，父子们却被川军白杆兵打得屡战屡败。由于之前部分流窜到贵州都指挥使司毕节卫的叛军联合了水西叛军，因此叛贼罗甸大王：安邦彦，打算派兵北上支援叛贼大梁王，却不想刚出毕节卫就在四川承宣布政使司镇雄府被大明川军部队击退。当时明贵州总督：杨述中，正在驻湖广承宣布政使司辰州府沅州，朝廷下令屡催各路贵州明军进剿土司叛军，因此明贵州总督就始移驻到贵州承宣布政使司镇远府。但明贵州总督却与明贵州总镇巡抚不和！这使得叛贼大梁王趁机逃入龙场驿依靠叛贼罗甸大王，明贵州总镇巡抚连忙召开会议决定派兵进剿，而明贵州总督却担心有伏兵？与诸将们皆以为不可，却还是被明贵州总镇巡抚力排群议下令出兵。